V strokovnih združenjih, društvih in sekcijah Slovenskega zdravniškega društva se povezujejo zdravniki in zobozdravniki na temelju skupnih strokovnih ali drugih interesov. Organizacije delujejo v skladu s pravilnikom, ki ga po odobritvi glavnega odbora ali glavnega strokovnega sveta sprejme ustrezni organ.
Strokovna združenja so organizirana na področjih temeljnih specializacij. V kolikor se v posamezni organizaciji povezujejo strokovnjaki različnih strokovnih področij, za katera se predvideva večje število interesentov (več kot 50), lahko po predhodnem soglasju Glavnega strokovnega sveta SZD ustanovijo združenje.